生前談起在晉綏地區的工作，李井泉總是謙虛地說：“講功績首先要講賀老總，我只是賀（龍）唱李（井泉）和！”

1945年8月，抗戰取得完全勝利，國民黨卻想獨攬勝利果實，國共內戰危機日重。就在當月，李井泉擔任晉綏野戰軍（司令員賀龍）政委，從賀龍的老部下成長為賀龍的好搭檔。1946年春，他正式就任中共中央晉綏分局書記（賀龍為常委）兼晉綏軍區政委，與賀龍一起成為中共在晉綏地區的主要領導。

為迎擊國民黨可能發動的大規模內戰，李井泉于 1946年6月19日主持召開了晉綏分局高級干部會議，他與賀龍在會上一致強調：國民黨打內戰是靠美國人，而我們是靠人民。真正把農民的土地問題解決了，群眾斗爭的積極性就會起來。會議根據黨中央指示，決定進行土地改革，并根據賀龍的建議通過決議：減輕農民負擔。人民的生產、支前的熱情大大提高，為晉綏地區解放戰爭的勝利準備了深厚的群眾基礎。談起這次高級干部會議，李井泉歸功于賀龍：“都是老總唱的戲！”賀龍真誠地說：“你可是分局書記啊！”

1946年11月，根據全面內戰爆發后國民黨大打出手的現實，賀龍、李井泉商量之后報經中央軍委批準，將晉綏野戰部隊組成三個縱隊。不久中共中央軍委即來命令，調其第一縱隊西渡黃河，保衛邊區。賀龍、李井泉二話沒說，親自到第一縱隊駐地，動員部隊愉快地服從命令。1947年3月，中共中央軍委又下令調晉綏第二縱隊開赴陜北。賀龍、李井泉照樣不折不扣地執行命令，送王震部過了黃河。

1947年12月，在賀龍、李井泉領導下，晉綏軍區和晉綏分局聯合召開對敵斗爭會議，全面檢查一年來的對敵斗爭，發現不少問題。根據黨中央十二月會議的精神，賀龍、李井泉主持通過會議決議：

地方工作要糾正過去的錯誤，正確執行政策，組織反對閻錫山、傅作義反動統治的統一戰線，集中打擊依附國民黨的惡霸地主，縮小打擊面；軍事斗爭上，地方兵團和游擊隊要進一步學習和貫徹毛澤東軍事思想，針對敵軍活動規律，適時集中優勢兵力，各個殲敵。在敵大兵團出動時，則集中更大的兵力，主動積極作戰。爭取在一兩年內，配合友鄰軍區奪取太原、歸綏，解放全山西、全綏遠。