當地大部分人民每年的生活費還不到1美元，有10%以上的兒童無法度過他們的5歲生日。成人當中有四分之三是文盲，只有1%的家庭有銀行戶頭。

此外，南蘇丹不僅和蘇丹北部仍存有戰爭隱憂，在內部也面對不同政治勢力的對抗。南蘇丹政府是由當地最大部族丁卡族掌控，但南方還未正式立國，已有7支反政府武裝部隊揚言要推翻政府。

南蘇丹政府發言人馬亞克說：“這只是部落斗爭。”他指出，這些部落沖突并不會影響國家穩定，但許多人都擔心，在南蘇丹正式獨立之后，丁卡族又會同其死對頭努爾族陷入苦戰。

即使是在丁卡族政府軍內部，其實也面對許多問題。政府軍經常在當地土地糾紛中偏袒某一方，一些士兵最近甚至開始騎劫運載糧食的聯合國卡車。

當地的安全問題已成為一大隱患，以致南蘇丹政府必須花費7億美元在同安全相關的事務上，這比政府撥給教育、醫藥、電力、工業和基礎設施等領域的總預算還要高。

不過，南蘇丹也是個擁有豐富資源的地區，每天可生產37.5萬桶石油。分析人士指出，南蘇丹缺乏煉油設施和向國外輸油的管道，而控制石油產業鏈的北方卻沒有石油，因此南北雙方要共同從石油資源中獲益，還得攜手合作才能取得雙贏局面。