該報告指出，使用抗草甘膦除草劑增加了草甘膦的噴灑量，但也減少了幾乎等量的其他除草劑噴灑量。這對環境來說是一個“凈收益”，因為草甘膦的毒性對動物的傷害更小，并且草甘膦在環境中持續的時間更短。該報告把轉基因作物與所替代的傳統農作物相比較，而不是與有機作物相比較。采用耐除草劑的作物也使農民控制雜草變得更加容易。 所謂的“免耕農業”有利于防止水土流失，并且保留了雨水中的沉淀物和化學物質，而這種改善了的水質可能被證明對農作物有很大好處，但報告指出如何衡量這些好處還有待研究。

據報道，其他轉基因作物主要包括轉BT基因玉米和轉BT基因棉花，即通過植入細菌的基因來使作物產生具有殺蟲性的物質。該報告指出，隨著轉BT基因作物的推廣，對化學殺蟲劑的使用正在逐漸減少。在抗蟲害壓力較重的地方，轉BT基因作物的使用減少了防蟲害成本并且增加了產量，因此增加了農民的收入。該報告指出，當剛開始推出轉基因作物時，一些作物的產量甚至低于傳統作物的產量，而這常常被批評家所引用。但新的研究表明轉基因技術要么增加了作物產量，要么不影響作物的產量。

來自內布拉斯加州的玉米和大豆種植者查克·邁爾斯（Chuck Myers）未參與撰寫該報告，他表示：“盡管生物工程技術沒有增加作物的內在產出能力，但它以幫助控制蟲害的方式保住了作物的產量，這已經解決了一大難題，給農民帶來了很大的利益。”